一、服务团队
健康医疗大数据西部研究院是中国科学院与重庆高新区合作、重庆高新区管委会举办的新型高端研发机构,长期承担建设、运营包括“中国自然人群生物资源库”在内的多个人群资源库的任务。
其中,“中国自然人群生物资源库”作为重庆国家重大科技基础设施培育项目,规划5年内建成我国第一个包括大规模自然人群队列生物样本、基因组学数据、健康医疗信息等多种类型战略性数据资源的“中国自然人群生物资源库”,为转化医学研究提供高质量样本和数据支持,为国家制定健康预防和干预政策提供科学依据,同时促进西部(重庆)科学城大健康人才、产业聚集与高质量发展。
通过与中国科学院合作,研究院技术团队在建设大型、超大型生物样本库,特别是样本库自动化、信息化管理方面,具有充分的技术积累和丰富的实践经验。
二、服务目标
引领国内人类遗传资源采集、保藏与利用工作的标准体系建设,确保生物医学领域研究工作的规范管理与技术安全,助推健康医疗大数据深度挖掘与技术转化,为科学前沿研究、产业创新发展提供强大的数据源泉与增长动力。
三、服务内容
根据用户单位实际需求,遵守国家相关法律法规与实验室安全通用原则,综合样本库行业技术标准及国家级项目建设经验,由研究院技术团队为用户提供人类遗传资源样本库的建设规划、相关人类遗传资源管理资质申请、ISO20387标准认可等咨询服务与申报指导。包括且不限于下列服务:
(一)智慧样本库标准化建设
1.生物样本管理:
(1)样本采集、登记运输、制备、出入库管理;
(2)样本销毁管理、捐赠者信息/伦理隐私管理;
(2)样本全生命周期追溯、质控管理/报告管理。
2.科研数据与项目管理:
(1)临床及科研关联数据管理;
(2)科研课题管理、研究队列管理、多中心管理等;
(3)重点患者信息库/随访管理、共享管理。
3.样本库日常管理:
(1)存储容器管理(图形化全模拟);
(2)人员管理、设备质量管理、样本质量管理;
(3)物料试剂耗材管理、文档管理、报警管理。
4.安全管理:
(1)角色管理、权限管理、关键参数监控系统;
(2)生物安全管理、数据安全管理、系统日志;
(3)应急管理、备份容灾、安全防护。
5.外部接口管理:
(1)HIS/LIS/CIS/EMR/PACS对接;
(2)整盘扫描装置对接;
(3)大屏数据展示系统、温度监控系统对接。
6.自动化设备对接
(1)对接自动化液体处理站、自动化液氮存储系统;
(2)对接智能机器人及挑管工作站;
(3)实现库区无人化样本自动存取和处理。
(二)智慧样本库规范化管理
1.构建规范工作流程
(1)知情同意流程;
(2)样本采集流程;
(3)样本接收流程;
(4)样本处理流程;
(5)样本存储流程;
(6)质量控制流程;
(7)样本出库流程;
(8)样本转运流程;
(9)报告管理流程。
2.构建科学空间布局
(1)场地选址与承重;
(2)强弱电改造、电力保障;
(3)温湿度与通风、照明控制;
(4)温度湿度、气体浓度监控;
(5)消防改造。
3.构建高效组织架构
(1)功能任务模块;
(2)样本出入库与存储管理;
(3)采集、处理、应用信息管理;
(4)质控信息管理及检测报告;
(5)出库转运流程。
4.构建保障支持体系
(1)伦理及法规;
(2)人员配置;
(3)场地规划与管理;
(4)设备设施管理;
(5)SOP规范的操作及标准验证。
(三)智慧样本库安全管理
1.样本及工作安全
(1)生物实验室安全操作;
(2)样本的废弃安全处理;
(3)耗材及废弃物安全处理;
(4)样本灾备预案;
(5)样本多设备存储备份的策略。
2.设计安全
(1)样本库的楼体承重;
(2)电路、空调、用水、污水等安全处理;
(3)空间内有害气体的安全监控;
(4)设置门禁等物理出入权限。
3.信息安全
(1)样本信息传递时的安全策略;
(2)系统权限明确设置;
(3)工作流及审批流的严格执行;
(4)数据的异地灾备。
4.设备安全
(1)配置专业的监控设备;
(2)做好断电、设备升温等预警工作,配置UPS;
(3)定时检修;
(4)必备的应急设备与应急预案。